Может ли обмен данными излечить рак?
Совместная работа аналитиков помогает найти ответы, скрытые в данных клинических исследований.
Элисон Болен (Alison Bolen), редактор SAS Insights
Представьте, что эффективность лечения рака можно оценить в течение нескольких дней или недель после назначения курса. Было бы здорово, правда?
Лечение онкологических заболеваний состоит из большого количества болезненных процедур и при этом никому не хочется проходить курс лечебной терапии, который не дает положительного эффекта. Иногда эффективность лечения можно оценить посредством сканирования, но зачастую пациенты понятия не имеют, эффективен ли выбранный курс, до тех пор, пока уже не станет поздно что-то менять.
Недавнее исследование показало, что простой анализ крови пациента может практически сразу рассказать, насколько эффективна терапия рака простаты. Это удалось выяснить благодаря данным, которые предоставили несколько фармацевтических компаний.
Исследование проводил доктор Говард Шер (Howard Scher), онколог мемориального онкологического центра имени Слоуна-Кеттеринга, глава отделения урогенитальной онкологии в центре имени Сидни Киммела, где занимаются изучением рака простаты и мочеполовой системы. В ходе вышеупомянутого исследования анализировались данные участников независимой некоммерческой программы Project Data Sphere (PDS). Эту программу реализует круглый стол директоров по вопросам диагностики онкологических заболеваний. PDS создана с целью обмена данными о клинических исследованиях третьей фазы для терапии рака, а также интеграции и анализа ретроспективных данных о пациентах. Команде Шера удалось использовать обезличенные данные из нескольких клинических испытаний третьей фазы для сравнения образцов крови в ходе лечения.
«Мы выявили клетки специфического типа с очень характерным паттерном, — рассказывает доктор Шер. — Этот паттерн прослеживается в крови и может служить маркером восприимчивости к терапии рака. Это просто невероятно. Если в крови есть эти клетки, то эффективность лечения сможет подтвердить простой анализ крови, еще задолго до того, как станут заметны первые результаты. Больше не придется проводить бесчисленные сканирования в ожидании видимых улучшений. Это действительно потрясающе».
Цель платформы Project Data Sphere по исследованию онкологических заболеваний — поддержка инноваций за счет внедрения новых методик исследований (например, исследования Шера, недавно опубликованные в журнале The Lancet Oncology). В поддержку этой инициативы компания SAS бесплатно предоставляет исследователям платформу для исследований и доступ к технологиям аналитики. Данные на этой платформе обезличены и соответствуют отраслевым нормативно-правовым требованиям.
Что происходит после клинических испытаний?
Главная задача фармацевтических компаний — как можно скорее вывести на рынок препараты и оборудование, которые гарантируют эффективное лечение пациентов. Но что произойдет после выхода препаратов на рынок и завершения клинических испытаний?
Скачайте официальный документ
О важности обмена данными
В ходе клинических испытаний накапливается огромный массив данных. В то же время, каждое новое клиническое исследование проводится с целью найти ответ на конкретный вопрос или проверить определенную гипотезу. Например, сможет ли новая терапия:
- быстрее победить болезнь?
- спасти жизни пациентов?
- сократить количество раковых клеток?
Даже отрицательные ответы могут здорово помочь исследователям, ведь полученные результаты можно будет использовать в дальнейшем. После завершения клинического исследования и фиксации его результатов полученные данные отправляются в архив, а исследователи продолжают свою работу.
Но что, если бы можно было взять данные по нескольким десяткам исследований, которые когда-то проводились разными фармацевтическими компаниями и научно-исследовательскими медицинскими центрами, и узнать что-то новое? Например, что поможет предотвратить развитие рака простаты? Или что может быстрее излечить рак груди?
Чтобы ответить, придется основательно покопаться в старых отчетах. Именно поэтому такие проекты, как PDS, так важны. Они дают новые возможности и помогают отвечать на вопросы, которые так и остались бы без ответа, если бы вся эта информация продолжала пылиться в архиве.
Те результаты, которые получили Шер и его команда — это только начало. По мере добавления данных из новых клинических исследований и их анализа, ученые смогут объединить усилия и найти ответы на вопросы, которые никто даже не пытался бы изучать в рамках одного испытания.
Что меня больше всего впечатлило в самом начале проекта Project Data Sphere, так это то, что он смог собрать вместе разные компании. Благодаря проекту они смогли наладить рабочие отношения и использовать данные максимально эффективно.
Патти Спирс (Patty Spears), исследователь и защитник интересов онкологических пациентов
Защитники интересов пациентов поддерживают обмен данными
Что думают сами пациенты об использовании данных клинических исследований в целях, которые не предусмотрены этими испытаниями? Защитники интересов пациентов подписали резолюцию об обмене ранее полученными данными клинических исследований в сфере онкологии. Теперь онкологических пациентов информируют о рисках, связанных с обменом данными, и они добровольно соглашаются с тем, что исследователи могут проводить расширенный анализ таких данных.
По сути, большинство онкологических пациентов принимают участие в клинических исследованиях по двум причинам:
- Они хотят получить доступ к новым методикам лечения, которые могут помочь им выздороветь.
- Они действительно заинтересованы в развитии науки, чтобы спасти жизни других пациентов.
«Довольно сложно попасть в исследовательскую программу. Трудно найти такую, которая полностью подойдет для конкретного курса лечения и типа онкологического заболевания. Поэтому у тех, кто все-таки смог стать участником клинических испытаний, очень высокая мотивация. Они действительно хотят сделать это ради самих себя и ради других пациентов», — говорит Патти Спирс, ученый, исследователь и защитник прав пациентов, которая сама победила рак груди.
Некоторым пациентам приходится тратить массу времени и сил на участие в клинических исследованиях. Например, Спирс сама принимала участие в клиническом исследовании уже после курса терапии в 1999 году. Ради этого ей приходилось каждый месяц ездить из Рейли, штат Северная Каролина, в Сиэтл.
«На испытание каждого конкретного препарата уходит действительно много времени, — говорит Спирс. — Если бы можно было объединить все данные и понять, куда двигаться дальше, то, возможно, это дало бы положительный эффект. Пациенты действительно хотят помочь. Было бы здорово, если бы можно было использовать данные независимо от результатов исследования».
Спирс говорит, что пациенты, с которыми она работает, хотят, чтобы их данные использовались максимально эффективно. Один мужчина сказал ей: «Можете мой геном хоть на автобус прилепить, мне все равно. Если это поможет кому-то из пациентов — я только за».
В отдельных случаях может быть полезно не только объединить данные, но и собрать людей вместе. «Что меня больше всего впечатлило в самом начале проекта Project Data Sphere, так это то, что он смог собрать вместе разные компании, — говорит Спирс. Благодаря проекту они смогли наладить рабочие отношения и использовать данные максимально эффективно».
По словам Спирс, проект PDS помог разрушить барьеры и сделать диалог между конкурирующими компаниями гораздо более открытым и осмысленным, чем это вообще можно было представить.
Развитие науки
Клинические исследования призваны решить множество задач. Для фармацевтических компаний они являются важным инструментом вывода новых препаратов на рынок. Онкологическим пациентам они дают надежду на улучшение здоровья и доступ к новым видам терапии. Эти исследования помогают медицине двигаться вперед. И все мы надеемся, что когда-нибудь лечение и предотвращение любой болезни станет возможным.
Наука не стоит на месте, она продолжает развиваться, особенно теперь, в эру точной медицины и геномного тестирования. И чем больше данных используется для решения проблемы, тем лучше.
Проект PDS дает надежду, что обмен данными и совместная работа поможет исследователям более эффективно проверять новые идеи и изучать новые методики борьбы с раком.
«Огромные массивы информации просто пылятся в архивах, это обычное дело, никто просто не обращает внимания, — говорит Шер. — Обмен данными поможет обратить внимание на существующие связи между явлениями, которые на первый взгляд кажутся совершенно несопоставимыми. Это может полностью изменить наше представление о том, что действительно важно».
Рекомендуем прочитать
- Article Fraud detection and machine learning: What you need to knowМашинное обучение является важной частью инструментария обнаружения мошенничества. Вот что вам нужно для начала работы.
- Article Will health care be fundamentally changed post-COVID-19?Many market forces are supporting the transformation to virtual digital health programs -- the COVID-19 pandemic is just the latest compelling event.
- Article Доработка модели глубокого обучения для обнаружения объектовЭто четвертый пост в моей серии публикаций о проекте компьютерного зрения, над которым я работала, чтобы идентифицировать опухоли печени при КТ-сканировании.
- Article Слияние IT / OT: проблема в восприятии IoTФеномен IoT требует тесного сотрудничества между информационными технологиями (IT) и операционными технологиями (OT). Но у IT и OT есть явные проблемы в восприятии целей и результатов IoT-инициатив. Том Брадичич объясняет, почему слияние IT / OT необходимо для успешных IoT-проектов.